记者从中国科学院自动化研究所获悉，该所多模态人工智能系统实验室与生物物理研究所蛋白质科学研究平台生物成像中心合作，以人工智能技术赋能原位结构生物学，提出了一种基于弱监督深度学习的快速准确颗粒挑选方法DeepETPicker，相关研究近日在国际学术期刊《自然·通讯》发表。
DeepETPicker 软件用户图形界面
据了解，DeepETPicker仅需要少量人工标注颗粒进行训练即可实现快速准确三维颗粒自动挑选。为降低对人工标注量的需求，该方法优选简化标签来替代真实标签，并采用了更高效的模型架构、更丰富的数据增强技术和重叠分区策略来提升小训练集时模型的性能；为提高颗粒定位的速度，采用GPU加速的平均池化-非极大值抑制后处理操作，与现有的聚类后处理方法相比提升挑选速度数十倍。此外，为方便用户使用，项目团队推出了操作简洁、界面友好的开源软件以辅助用户完成图像预处理、颗粒标注、模型训练与推理等操作。使用该方法从冷冻电子断层扫描图像中挑选颗粒的整体工作流程包括训练阶段和推理阶段。
使用 DeepETPicker 从冷冻电子断层扫描图像中挑选颗粒的整体工作流程
研究团队将DeepETPicker与目前性能最优的颗粒挑选方法在多种冷冻电子断层扫描数据集上进行了性能评估对比，结果表明，该方法在仿真与真实数据集上均可实现快速准确的颗粒挑选，其综合性能明显优于现有的其他方法，生物大分子结构重建达到的分辨率也达到采用专家人工挑选颗粒进行结构重建同样的水平，这进一步体现了该方法在原位高分辨率结构解析中的实用价值，将为原位结构生物学研究提供有力支持。
采用定量指标评估DeepETPicker在EMPIAR-10045实验数据集上的粒子挑选性能
细菌锰离子外排对于锰离子和铁离子稳态均具有重要意义。TerC家族蛋白是存在于所有细菌中的一种保守蛋白质。然而，长期以 2019年，我国新能源汽车产销量刚刚迈过100万辆的关口不久，当时市场渗透率约为5%。之后的5年时间，我国新能源汽车的发展 大学校门要全面敞开吗？开放程度如何把握？ 近日，北京大学李植副教授发表文章《从今天与保安比赛跑步说起——北京大学的门卫 “忙”，已经成为很多科研人员的常态，他们忙着很多事，唯独很难静下心来忙学问。 中国科学院院士刘忠范将很多被迫忙碌 ·“这项研究似乎说明，长期生活在食品不安全的状况中所带来的危害是没那么容易逆转的。研究也表明，对于那些因 2023年12月中旬以来，受冷空气持续影响，我国天气形势复杂，集中出现寒潮、雨雪、低温、冰冻等灾害性天气。 近日，中国科学院 。本文链接：人工智能赋能原位结构生物学取得新进展http://www.sushuapos.com/show-11-3762-0.html
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