先天性角膜营养不良通常可以治疗，但无法完全治愈。治疗方案主要有佩戴角膜接触镜、使用人工泪液、进行角膜移植手术、接受基因治疗、配合营养支持等。
1、佩戴角膜接触镜
硬性透气性角膜接触镜可矫正因角膜表面不规则导致的散光，同时保护受损的角膜上皮。适用于角膜基质层受累但未出现严重水肿的患者，需定期复查调整镜片参数。
2、使用人工泪液
玻璃酸钠滴眼液、羧甲基纤维素钠滴眼液等能缓解眼表干燥症状。对于上皮型角膜营养不良患者，无防腐剂的人工泪液可减少角膜刺激，建议选择单支包装剂型。
3、角膜移植手术
板层角膜移植适用于病变未累及内皮层的患者，穿透性角膜移植用于全层角膜混浊病例。术后需长期使用环孢素滴眼液等抗排斥药物，存在移植排斥风险。
4、基因治疗
针对特定基因突变类型如TGFBI基因相关营养不良，正在研究的基因编辑技术可能未来应用于临床。目前仍处于实验阶段，需通过遗传咨询评估可行性。
5、营养支持
补充维生素A、必需脂肪酸等营养素有助于维持角膜代谢。合并睑缘炎患者需增加Omega-3摄入，但无法逆转已形成的角膜混浊病变。
患者应避免揉眼等机械刺激，外出佩戴防紫外线眼镜。定期进行角膜地形图检查监测病情进展，重度视力障碍者可申请低视力康复服务。注意保持环境湿度，睡眠时使用眼罩保护。合并青光眼或白内障需优先处理这些并发症，儿童患者建议每三个月复查屈光状态。所有治疗均需在眼科医生指导下个体化实施。
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