新生儿甲状腺异常是否严重需结合具体类型判断，多数情况下通过早期筛查和规范治疗可有效控制，但未及时干预可能导致智力发育迟缓等严重后果。
新生儿甲状腺异常主要包括先天性甲状腺功能减退症和暂时性甲状腺功能异常两类。先天性甲状腺功能减退症若未在出生后1-2个月内开始甲状腺激素替代治疗，可能造成不可逆的神经系统损害，表现为运动发育滞后、智力低下、身材矮小等。暂时性甲状腺异常多与母体抗体或碘摄入异常相关，通常在3-6个月内自行恢复，但仍需定期监测甲状腺功能变化。
部分罕见病例可能出现甲状腺发育不全或异位甲状腺，这类情况需要终身服药维持。极少数新生儿甲状腺毒症病例可能出现心动过速、体重不增等危象表现，需立即住院治疗。新生儿甲状腺癌虽然发生率极低，但具有侵袭性强的特征，需通过手术和放射性碘治疗。
所有新生儿出生后均需进行足跟血筛查，确诊异常者应每2-4周复查甲状腺功能直至稳定。哺乳期母亲需保持适量碘摄入，避免使用影响甲状腺功能的药物。家长应定期监测患儿身高体重曲线、神经行为发育里程碑，发现喂养困难、黄疸消退延迟、异常嗜睡等症状时需及时复诊。
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