4月16日，百奥几何正式发布全球首个全场景原子级蛋白质大模型GeoFlow V2，该模型首次以原子级精度统一蛋白质结构预测与从头设计两大核心能力，实现了蛋白质结构预测与从头设计一体化。
凭借蛋白质复合物结构预测与建模能力，GeoFlow V2能在各种约束条件下精准预测对接结构，广泛适用于抗原-抗体、蛋白-蛋白及蛋白-小分子等交互体系。在以抗体设计为代表的蛋白质设计任务中，GeoFlow V2生成结构的表位遵从性、CDR 结合率、虚拟筛选通过率均表现良好，在同样设计数量的前提下，能生成更多具有功能的候选分子，提升蛋白设计项目的成功率。
以往蛋白质发现和设计，大多依赖自然界进化出的复杂体系，如动物免疫发现抗体，或者高通量实验进行规模化试错，以及领域专家经验的理性设计。GeoFlow V2则提供了可定义、可优化、可规模化量产的蛋白质设计方案。
如在跨膜蛋白可溶化改造中能构建出能在水溶液中稳定存在，同时保持胞外区结构和功能特性的跨膜蛋白序列，其中90%可实现稳定可溶表达，多条序列与原始蛋白的胞外区结合特异性相同，但跨膜区仅有22%的序列相似性，表现出较好的设计创新性与工程适应性。
GeoFlow V2在跨膜蛋白可溶化改造中的表现（百奥几何供图）
据悉，百奥几何由加拿大魁北克省人工智能研究中心（Mila）副教授、加拿大高等研究院（CIFAR）人工智能讲席教授唐建创立，图灵奖获得者 Yoshua Bengio 担任首席科学顾问，
致力于从头打造可编程的蛋白质，并将其应用于生物医药和合成生物学。
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