科技日报讯 （记者张佳欣）据物理学家组织网近日报道，瑞士洛桑联邦理工学院的研究团队开发出一种名为“全蛋白质生成潜在扩散”（LD-FPG）的新型AI框架，首次生成精确到每个原子的蛋白质完整动态模型，并能模拟其运动过程。该成果有望从根本上改变基于蛋白质动态行为的药物设计方式。
许多药物和抗体的研发路径，都聚焦于结构复杂的细胞膜蛋白。当候选药物分子与这些蛋白结合时，会触发一连串化学反应，改变细胞行为。因此，理解蛋白质如何折叠、如何运动，是开发高效靶向药物的关键。
目前，AI已成为生成新型蛋白质结构的重要工具，但包括“阿尔法折叠”在内的大多数系统，主要生成蛋白质的静态“快照”。在实际情况下，蛋白质内部被称为“侧链”的结构中，原子会发生细微重排，这些变化会影响蛋白质与其他分子的相互作用，而现有模型通常难以捕捉这些动态细节。
为了解决这一问题，研究团队开发了LD-FPG框架。与传统方法不同，LD-FPG并不直接预测每个原子在空间中的精确坐标，而是先学习蛋白质形态变化的规律。该系统利用名为“图神经网络”的算法框架，将蛋白质结构压缩成简化的“潜在图谱”，再由AI学习这些图谱中的结构和运动特征，最终重建出包含全部原子及其动态变化的高分辨率模型。
研究团队利用该系统，生成了多巴胺D2受体在活跃和非活跃状态下的动态结构。该蛋白可识别神经递质多巴胺并调控关键细胞反应，是G蛋白偶联受体中的重要成员，也是全球药物研发领域最受关注的靶点之一。
新框架不再只关注蛋白质的静态形状，而是关注其运动过程，为设计针对蛋白质动态行为的新药打开了大门。在提升生物学理解的同时，这项技术还有望改进当前依赖大量试错的蛋白质虚拟筛选流程，从而加速药物发现。
12月16~17日，“第一届集成芯片和芯粒大会”在上海举行。 在会上，国家自然科学基金委领导介绍了“集成芯片前沿技术 12月20日，由清华大学牵头、中国电信集团有限公司等单位联合制定的“RFC6052、RFC6145和RFC7599等国际IPv6技术创新IETF R 12月16日，2023第二届可持续能源发展国际会议在北京开幕。此次会议以“零碳科技、创新未来”为主题，汇聚了来自全球多 2日，世界华人数学家联盟2023年会在复旦大学开幕。这是世界华人数学家联盟年会首次在上海举行。当天，上海数学与交叉学 据“浙江大学”微信公众号1月2日消息，加利福尼亚大学伯克利分校数学系正教授孙崧日前加盟浙江大学数学高等 据江苏省扬州市职业大学网站消息，扬州市职业大学教学督导室2023年12月28日发布《2023-2024学年第一学期教师及学生座谈 。本文链接：AI生成蛋白质完整动态模型http://www.sushuapos.com/show-11-34519-0.html
声明：本网站为非营利性网站，本网页内容由互联网博主自发贡献，不代表本站观点，本站不承担任何法律责任。天上不会到馅饼，请大家谨防诈骗！若有侵权等问题请及时与本网联系，我们将在第一时间删除处理。
上一篇： 合成生物学核心愿景达成还要多久
下一篇： 中国指挥与控制学会拟新增10名会士