保守非编码元件（CNEs）是一类不编码蛋白质、但在长期进化过程中保持高度保守的DNA序列，在基因表达调控等生物学过程中发挥重要作用。随着基因组测序数据积累，如何从大规模、跨物种基因组数据中高效、准确地鉴定CNEs，并解析其进化模式，成为比较基因组学和生物信息学研究面临的重要挑战。
中国科学院成都生物研究所研究团队开发了集全基因组比对、CNEs鉴定和快速进化评估于一体的模块化分析工具CNEwrap，创新性地提出了快速进化评估算法EvoAcc，能够精确高效地鉴定指定物种或谱系中CNEs的快速进化信号。
研究人员在不同进化情景下对EvoAcc与现有主流快速进化检测算法进行了比较。结果显示，EvoAcc具有较高的预测准确率和精确率，且CPU占用和内存消耗的增长速率均低于其他同类算法。
CNEwrap实现了从全基因组比对、CNEs鉴定到快速进化评估的全流程自动化分析，降低了跨物种比较基因组分析的技术门槛和使用成本，为大规模基因组CNEs的系统鉴定及其进化动态解析提供了一套兼具高效性与准确性的分析方案，并有望为保护生物学相关的功能基因组学、群体基因组等研究提供有效的方法学补充。
相关研究成果发表在《核酸研究》（Nucleic Acids Research）上。研究工作得到国家重点研发计划、国家自然科学基金和四川省科技计划等的支持。
论文链接
保守非编码元件鉴定流程与评估算法EvoAcc核心组成
11月6日上午，淮北师范大学在滨湖校区行政楼309会议室召开博士点培育建设专题会。校领导毕明福、曹灯明出席会议，校党委常 当地时间10月31日至11月1日，2024年全球教育会议在巴西福塔莱萨召开。会议围绕“科学、技术、创新与数字变革”和“高等教育的公平机会、质量和流动性”等议题进行讨论。教育部副部长、中国联合国教科文组织全国委 中国教育报-中国教育新闻网讯（特约通讯员 苏勤）日前，内蒙古通辽市确定科尔沁区为全市首批深化新时代教育评价改革试点地区，通辽市第一中学等22所学校（幼儿园）为全市首批深化新时代教育评价改革试点 中国教育报-中国教育新闻网讯（记者 杨国良 通讯员 陶亚雄）近日，中国—印尼“长江数智工匠学院”启动仪式在重庆电子科技职业大学两江校区举行。重庆电子科技职业大学党委书记张伟、印度尼西亚通 中国教育报-中国教育新闻网讯（记者 董鲁皖龙 通讯员 于泓超）近日，湖州职院建筑工程学院收到喜讯，该院4位学生组成的市政数字化技术创新团队在2024年世界职业院校技能大赛总决赛争夺赛—高职组土 中国教育报-中国教育新闻网讯（记者 陈欣然）11月6日，2024年全国精细化工行业产教融合共同体年度会议暨“校企对接”交流会在天津召开。本次大会由中国化工教育协会指导，天津职业大学主办，天津大学 。本文链接：科研人员开发出大规模基因组CNEs鉴定与进化评估新工具http://www.sushuapos.com/show-12-4480-0.html
声明：本网站为非营利性网站，本网页内容由互联网博主自发贡献，不代表本站观点，本站不承担任何法律责任。天上不会到馅饼，请大家谨防诈骗！若有侵权等问题请及时与本网联系，我们将在第一时间删除处理。
下一篇： 研究揭示大型水库消落带磷稳定性调控机制