美国麻省理工学院化学家们利用生成式人工智能(AI)技术,开发出一种可快速预测三维基因组结构的新模型。新模型能在几分钟内预测出数千种结构,速度远超现有的实验分析方法。研究成果发表于最新一期《科学进展》杂志。
人体每个细胞都含有相同的遗传序列,但每个细胞只表达其中一部分基因。这种细胞特异性的基因表达模式确保了不同类型细胞之间的差异,而这些表达模式部分取决于遗传物质的三维结构。
新模型名为ChromoGen,旨在从底层DNA序列出发,预测三维基因组结构。它包括两个组成部分,第一部分是一个深度学习模型,能够“读取”基因组,分析编码在DNA序列和染色质可访问性数据中的信息;第二部分是一个生成式AI模型,经过训练后能够预测出物理上准确的染色质构象。
训练该模型所用的数据集包括超过1100万个染色质构象,这些数据来源于对16个人类B淋巴细胞系单细胞进行的实验。
ChromoGen模型能有效地捕捉序列—结构关系,为每段DNA序列生成多种可能的结构。这是因为DNA是一种非常无序的分子,同一个DNA序列可以产生许多不同的构象。这种方法不仅大大加速了三维基因组结构的预测过程,也为深入研究基因组的三维组织如何影响细胞的基因表达模式和功能提供了有力工具。
这一突破性技术有望帮助科学家更快地理解基因调控机制,促进疾病治疗和生物技术领域的进步。
美国麻省理工学院化学家们利用生成式人工智能(AI)技术,开发出一种可快速预测三维基因组结构的新模型。新模型能在几分钟内预测出数千种结构,速度远超现有的实验分析方法。研究成果发表于最新一期《科学进展》杂志。
人体每个细胞都含有相同的遗传序列,但每个细胞只表达其中一部分基因。这种细胞特异性的基因表达模式确保了不同类型细胞之间的差异,而这些表达模式部分取决于遗传物质的三维结构。
新模型名为ChromoGen,旨在从底层DNA序列出发,预测三维基因组结构。它包括两个组成部分,第一部分是一个深度学习模型,能够“读取”基因组,分析编码在DNA序列和染色质可访问性数据中的信息;第二部分是一个生成式AI模型,经过训练后能够预测出物理上准确的染色质构象。
训练该模型所用的数据集包括超过1100万个染色质构象,这些数据来源于对16个人类B淋巴细胞系单细胞进行的实验。
ChromoGen模型能有效地捕捉序列—结构关系,为每段DNA序列生成多种可能的结构。这是因为DNA是一种非常无序的分子,同一个DNA序列可以产生许多不同的构象。这种方法不仅大大加速了三维基因组结构的预测过程,也为深入研究基因组的三维组织如何影响细胞的基因表达模式和功能提供了有力工具。
这一突破性技术有望帮助科学家更快地理解基因调控机制,促进疾病治疗和生物技术领域的进步。
3月18日,中国经济信息社(以下简称中经社)垂直领域数字化应用系统发布仪式在北京举行。在发布仪式上,锚定建设“国家级经济信息旗舰”的目标,中经社推出了八大数字化应用系统。中经社此次发布的行 美国太平洋西北国家实验室的科学家设计了一种复合装饰材料,可以储存更多二氧化碳,提供了一种既符合建筑规范,又比标准复合饰面板便宜的“负碳”选择。研究人员于18日在美国化学会春季会议上公布 3月21日是世界睡眠日,中国主题为“健康睡眠 人人共享”。近日发布的《2023年中国居民睡眠白皮书》显示,我国居民平均睡眠时长6.75小时,平均在零点后入睡,夜间睡眠时长普遍偏短。你是否有睡眠困扰 3月19日,记者从中国科学院海洋研究所了解到,该所研究团队在国际上首次发布了银鲳的高质量染色体水平参考基因组。相关研究论文近日在线发表于《自然》子刊《科学数据》。银鲳广泛分布于西北太 据英国《自然》周刊网站3月19日报道,研究人员首次利用生成式人工智能(AI)制造出全新抗体。报道称,本周生物学预印本资料库中的一份预印本报告的原理验证研究,提高了将“AI指导的蛋白质设计引入治 随着无人驾驶技术的快速发展,无人车在城市配送、环卫清扫、安防巡逻等应用场景中已得到较好示范应用。3月22日,南京溧水经济开发区管委会与南京易咖智车科技有限公司联合举办“金陵智地 易启未 。本文链接:生成式AI快速预测三维基因组结构http://www.sushuapos.com/show-2-10565-0.html
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