肿瘤组织具有高度异质性,这导致传统的空间转录组技术难以全面揭示其特性。2月20日,记者从西安交通大学获悉,为了解决这一难题,该校教授叶凯及其团队提出了STMiner方法,即利用基因表达的空间分布来构建肿瘤组织的整体计算框架,相关研究成果于近日发表在《细胞·基因组学》杂志上。
叶凯表示,传统方法通常将肿瘤组织的采样点视为独立的“房子”,统计每个采样点的细胞类型和基因表达信息。然而肿瘤组织细胞类型多样、基因表达杂乱无章、区域界限模糊,传统办法很容易产生误差。STMiner方法能利用二维高斯混合模型和最优传输理论,将离散的采样点转化为连续的基因分布地图,就像把零散的房屋信息绘制成一张完整的居民分布图。这不仅能更准确地反映肿瘤组织的真实情况,还能减少干扰信息,帮助科学家更清晰地观察基因的空间分布规律。
凭借这一方法,叶凯教授团队成功定位了高度复杂、边界不清的肿瘤组织中的独特基因表达模式,清晰区分了正常与异常组织的边界,并识别出一些此前被忽视的关键基因和空间结构。
肿瘤组织具有高度异质性,这导致传统的空间转录组技术难以全面揭示其特性。2月20日,记者从西安交通大学获悉,为了解决这一难题,该校教授叶凯及其团队提出了STMiner方法,即利用基因表达的空间分布来构建肿瘤组织的整体计算框架,相关研究成果于近日发表在《细胞·基因组学》杂志上。
叶凯表示,传统方法通常将肿瘤组织的采样点视为独立的“房子”,统计每个采样点的细胞类型和基因表达信息。然而肿瘤组织细胞类型多样、基因表达杂乱无章、区域界限模糊,传统办法很容易产生误差。STMiner方法能利用二维高斯混合模型和最优传输理论,将离散的采样点转化为连续的基因分布地图,就像把零散的房屋信息绘制成一张完整的居民分布图。这不仅能更准确地反映肿瘤组织的真实情况,还能减少干扰信息,帮助科学家更清晰地观察基因的空间分布规律。
凭借这一方法,叶凯教授团队成功定位了高度复杂、边界不清的肿瘤组织中的独特基因表达模式,清晰区分了正常与异常组织的边界,并识别出一些此前被忽视的关键基因和空间结构。
造成女性更容易睡不好的原因是多方面的,包括更年期等生理周期等,而女性长期的失眠除了会导致内分泌进一步失调,还会诱发心脏病、高血压、糖尿病、免疫力低下、记忆下降、脱发、皮肤松弛等。北京 3月21日上午,全球首列氢能源市域列车在中车长客股份公司(以下简称“中车长客”)试验线上进行了时速160公里满载运行试验。当日试验过程中,车以160公里/小时速度运行的列车,每公里实际运行平均能耗 我国成功发射云海二号02组卫星 中新网北京3月21日电(马帅莎 曹译 张艳)北京时间2024年3月21日13时27分,我国在酒泉卫星发射中心使用长征二号丁运载火箭/远征三号上面级,成功将云海二号02组卫星发射升空,卫星顺利 3月23日消息,vivo即将于3月26日发布vivo X Fold3系列折叠屏电话,其中包含vivo X Fold3和vivo X Fold3 Pro两款新品。据悉,vivo X Fold3采用了首发的碳纤维龙骨铰链,重量仅为219克,厚度为4.65毫米。相 在近日开幕的中国国际核工业展览会上,中国核学会理事会党委书记、理事长王寿君表示,中国内地现有在运核电机组55台、居全球第三;在建核电机组26台,保持全球第一。这些成绩的取得,离不开智能化技术 作为功能机时代的霸主,诺基亚手机曾经创造了巨大的辉煌,但也因错失智能手机发展机遇而“掉队”。近期,外媒Visual Capitalist统计了有史以来最畅销的15款手机型号,其中诺基亚和苹果包揽前十。今 。本文链接:新方法准确反映肿瘤组织真实情况http://www.sushuapos.com/show-2-10828-0.html
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