肿瘤组织具有高度异质性,这导致传统的空间转录组技术难以全面揭示其特性。2月20日,记者从西安交通大学获悉,为了解决这一难题,该校教授叶凯及其团队提出了STMiner方法,即利用基因表达的空间分布来构建肿瘤组织的整体计算框架,相关研究成果于近日发表在《细胞·基因组学》杂志上。
叶凯表示,传统方法通常将肿瘤组织的采样点视为独立的“房子”,统计每个采样点的细胞类型和基因表达信息。然而肿瘤组织细胞类型多样、基因表达杂乱无章、区域界限模糊,传统办法很容易产生误差。STMiner方法能利用二维高斯混合模型和最优传输理论,将离散的采样点转化为连续的基因分布地图,就像把零散的房屋信息绘制成一张完整的居民分布图。这不仅能更准确地反映肿瘤组织的真实情况,还能减少干扰信息,帮助科学家更清晰地观察基因的空间分布规律。
凭借这一方法,叶凯教授团队成功定位了高度复杂、边界不清的肿瘤组织中的独特基因表达模式,清晰区分了正常与异常组织的边界,并识别出一些此前被忽视的关键基因和空间结构。
肿瘤组织具有高度异质性,这导致传统的空间转录组技术难以全面揭示其特性。2月20日,记者从西安交通大学获悉,为了解决这一难题,该校教授叶凯及其团队提出了STMiner方法,即利用基因表达的空间分布来构建肿瘤组织的整体计算框架,相关研究成果于近日发表在《细胞·基因组学》杂志上。
叶凯表示,传统方法通常将肿瘤组织的采样点视为独立的“房子”,统计每个采样点的细胞类型和基因表达信息。然而肿瘤组织细胞类型多样、基因表达杂乱无章、区域界限模糊,传统办法很容易产生误差。STMiner方法能利用二维高斯混合模型和最优传输理论,将离散的采样点转化为连续的基因分布地图,就像把零散的房屋信息绘制成一张完整的居民分布图。这不仅能更准确地反映肿瘤组织的真实情况,还能减少干扰信息,帮助科学家更清晰地观察基因的空间分布规律。
凭借这一方法,叶凯教授团队成功定位了高度复杂、边界不清的肿瘤组织中的独特基因表达模式,清晰区分了正常与异常组织的边界,并识别出一些此前被忽视的关键基因和空间结构。
3月17日,记者从陆军军医大学西南医院获悉,该院消化内科教授陈磊团队联合陆军军医大学教授张定林首次提出,活性氧响应性纳米材料能够把程序性死亡配体-1蛋白精准传递到肠道炎症部位,有效缓解肠炎 据法新社3月18日报道,周一,美国半导体巨头英伟达公司发布了其最新型号的电子芯片,这些芯片旨在支持人工智能(AI)革命,英伟达正努力巩固其作为人工智能领域关键供应商的地位。“我们需要更加强大的 在3月24日世界防治结核病日前夕,比尔及梅琳达∙盖茨医学研究所(以下简称盖茨医学研究所)宣布,启动评估结核病候选疫苗M72有效性的Ⅲ期临床试验。在Ⅱb期试验中,数据显示这一新疫苗可为艾滋病毒检 30台发动机助进阶版“鹊桥”升空 中新社西安3月20日电 (记者 张一辰)3月20日8时31分,长征八号遥三运载火箭在中国文昌航天发射场顺利升空,成功将“鹊桥二号”卫星送入预定轨道。作为公共中继星平台,“鹊桥二号” 盲视技术已在猴子身上见效!马斯克脑机接口公司新目标:让盲人重见光明 澎湃新闻记者 吴遇利 Neuralink新技术或将造福数千万名失明人士。 当地时间3月21日,特斯拉CEO埃隆・马斯克在社交平台X(原推特)发文称, 3月23日,“天卫科技03星”暨“华祥苑壹号”卫星在厦门举行出征仪式,这是由厦门本土企业天卫科技制造研发的第三颗服务当地建设的商业卫星,标志着厦门航天卫星应用领域商业化、产业化发展更进一 。本文链接:新方法准确反映肿瘤组织真实情况http://www.sushuapos.com/show-2-10828-0.html
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