瑞士洛桑联邦理工学院开发了一种名为CARBonAra的新型人工智能(AI)驱动模型。该模型可以根据不同分子环境所施加限制的主链支架预测蛋白质序列,有望在蛋白质工程及包括医学和生物技术在内的多个领域带来重大进展。这一成果发表在最新一期《自然·通讯》杂志上。
CARBonAra是在一个包含约370000个亚基的数据集上进行训练的。它还从蛋白质数据库中额外选取了100000个亚基用于验证,70000个亚基用于测试。
CARBonAra建立在该团队开发的蛋白质结构转换器框架的基础上。它使用了几何转换器,是一种深度学习模型,可以处理点之间的空间关系(如原子坐标),以学习和预测复杂的结构。该模型突出特点是“上下文”感知能力,这在提高序列恢复率方面尤为明显。
当CARBonAra包含分子“上下文”,如蛋白质与其他蛋白质、核酸、脂质或离子的界面时,其恢复率显著提高。
该模型不仅在合成基准测试中表现出色,还经过了实验验证,其灵活性和准确性为蛋白质工程开辟了新的途径,增强了未来药物发现的能力。CARBonAra在酶工程方面的成功也展示了其在工业应用中的潜力。
瑞士洛桑联邦理工学院开发了一种名为CARBonAra的新型人工智能(AI)驱动模型。该模型可以根据不同分子环境所施加限制的主链支架预测蛋白质序列,有望在蛋白质工程及包括医学和生物技术在内的多个领域带来重大进展。这一成果发表在最新一期《自然·通讯》杂志上。
CARBonAra是在一个包含约370000个亚基的数据集上进行训练的。它还从蛋白质数据库中额外选取了100000个亚基用于验证,70000个亚基用于测试。
CARBonAra建立在该团队开发的蛋白质结构转换器框架的基础上。它使用了几何转换器,是一种深度学习模型,可以处理点之间的空间关系(如原子坐标),以学习和预测复杂的结构。该模型突出特点是“上下文”感知能力,这在提高序列恢复率方面尤为明显。
当CARBonAra包含分子“上下文”,如蛋白质与其他蛋白质、核酸、脂质或离子的界面时,其恢复率显著提高。
该模型不仅在合成基准测试中表现出色,还经过了实验验证,其灵活性和准确性为蛋白质工程开辟了新的途径,增强了未来药物发现的能力。CARBonAra在酶工程方面的成功也展示了其在工业应用中的潜力。
随着历史的车轮驶入2024年,大模型、AIGC等话题引发广泛热议,云计算与AI技术展现出了前所未有的深度融合趋势,就如同寒武纪的生物大爆发,激发着各行各业的创新浪潮。新质生产力时代到来,政企用云进 记者19日从西北大学获悉,该校地质学系、大陆动力学国家重点实验室刘鹏副教授与中国地质大学(北京)李国武教授团队申请的两种新矿物,近日经国际矿物学学会新矿物命名与分类专业委员会审查、投票,均 据法新社巴黎3月15日报道,15日发布的一项新的重要分析称,影响神经系统的疾病——如中风、偏头痛和痴呆症——已经超过心脏病,成为全球范围内导致人们健康损害的主要原因。 日本《朝日新闻》近日发表题为《深海之光——极端环境是创意宝库》的文章,作者是樱井林太郎,编译如下:在被称为最后未开垦地的深海,有着低温、高压、黑暗等极限环境。能否从这些极限环 英国科学家首次创造了一个新颖的实验平台,即“量子龙卷风”。它能模拟超流体氦中的黑洞,使研究人员能更详细地观察类似黑洞的行为以及与周围环境的相互作用。通过对超流体氦表面微波动力学的观 3月25日消息,去年huawei在Mate 60系列上首发了玄武机身架构,采用一体化金属机身,搭配上超耐用锦纤材质,使整机的抗挤压能力提高10倍,使用更放心。“玄武”是极其坚固的代表,huawei还在问界M9上采用了“ 。本文链接:预测蛋白质序列的新AI模型问世http://www.sushuapos.com/show-2-7904-0.html
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