记者11月12日从华大生命科学研究院获悉，该院联合斯坦福大学医学院、武汉大学电子信息学院等机构科研人员，借鉴多个跨学科领域数学模型，开发出三维时空建模工具包Spateo，可支撑胚胎发育、脑科学、疾病等领域研究。相关研究成果于11日发表在国际学术期刊《细胞》上。
“与其他方法不同，Spateo不会仅将生物系统视为单个细胞，而是会将其视为一个相互连接的整体，这在揭示先天性疾病背后的分子机制方面具有巨大的潜力。”斯坦福大学医学院教授邱肖杰说。
据悉，Spateo工具包提供多种算法选择，具备三维重建、区域数字化、细胞间相互作用推断、形态计量向量场以及用于交互式操作的可视化界面等独特优势。
为验证其性能，研究团队以小鼠胚胎和果蝇发育的研究为例，探索出三维空间中随时间变化的器官生态形成机制，并构建起小鼠胚胎发育的“3D分子全息图”。同时，研究团队采用多个空间组学数据集对Spateo进行验证，包括小鼠脑、人类淋巴瘤、猴脑和小鼠胚胎。
结果显示，Spateo在准确性、计算速度、内存消耗、可重建的切片间距和可处理的细胞数量等方面均优于目前国际主流重建算法。
此外，Spateo的三维重建算法，在拓展到两个甚至多个完成重建的三维胚胎的配准工作时，能够自然地捕捉跨时间点的细胞迁移、凋亡和分裂分化事件，在细胞层面解决了胚胎形态发生学的关键问题。
华大生命科学研究院博士白寅琪表示，Spateo工具包已开源，兼容目前包括华大时空组学技术Stereo-seq在内所有的空间组学技术。
记者11月12日从华大生命科学研究院获悉，该院联合斯坦福大学医学院、武汉大学电子信息学院等机构科研人员，借鉴多个跨学科领域数学模型，开发出三维时空建模工具包Spateo，可支撑胚胎发育、脑科学、疾病等领域研究。相关研究成果于11日发表在国际学术期刊《细胞》上。
“与其他方法不同，Spateo不会仅将生物系统视为单个细胞，而是会将其视为一个相互连接的整体，这在揭示先天性疾病背后的分子机制方面具有巨大的潜力。”斯坦福大学医学院教授邱肖杰说。
据悉，Spateo工具包提供多种算法选择，具备三维重建、区域数字化、细胞间相互作用推断、形态计量向量场以及用于交互式操作的可视化界面等独特优势。
为验证其性能，研究团队以小鼠胚胎和果蝇发育的研究为例，探索出三维空间中随时间变化的器官生态形成机制，并构建起小鼠胚胎发育的“3D分子全息图”。同时，研究团队采用多个空间组学数据集对Spateo进行验证，包括小鼠脑、人类淋巴瘤、猴脑和小鼠胚胎。
结果显示，Spateo在准确性、计算速度、内存消耗、可重建的切片间距和可处理的细胞数量等方面均优于目前国际主流重建算法。
此外，Spateo的三维重建算法，在拓展到两个甚至多个完成重建的三维胚胎的配准工作时，能够自然地捕捉跨时间点的细胞迁移、凋亡和分裂分化事件，在细胞层面解决了胚胎形态发生学的关键问题。
华大生命科学研究院博士白寅琪表示，Spateo工具包已开源，兼容目前包括华大时空组学技术Stereo-seq在内所有的空间组学技术。
3月18日，在2024年黑龙江农机产品展示交易会上，一部可智能播种，又可助力增产的电驱气吸播种机引发众人关注。这台高端智能电驱气吸播种机的价格与机械播种机价格相当，据悉，研发团队通过自主研发和 近日，我国“主要作物丰产增效科技创新工程”重点专项“优质双季超级稻丰产增效技术研发与集成示范”项目，在湖南岳阳宣布启动。据了解，该项目主要聚焦优质双季超级稻丰产增效技术研发，着力探明双 21世纪经济报道记者 石恩泽 深圳报道操作系统似乎对地理入迷。鸿蒙和深圳，就像Windows和西雅图，也似Linux和赫尔辛基。这是地理与技术的紧密交融。深圳，可以说是鸿蒙的诞生之地，在全球科 3月23日消息，vivo即将于3月26日发布vivo X Fold3系列折叠屏电话，其中包含vivo X Fold3和vivo X Fold3 Pro两款新品。据悉，vivo X Fold3采用了首发的碳纤维龙骨铰链，重量仅为219克，厚度为4.65毫米。相 在日常生活中，隧道可以帮助人们翻山越岭。在植物细胞内，当内部物质穿过细胞膜时，往往也会通过类似的“隧道”。记者从中国科学技术大学获悉，该校孙林峰团队在第六大植物激素——油菜素 美国佐治亚理工学院机械工程师开发了一种控制机器人外骨骼的通用方法。无需专门训练、特别校准，对复杂算法进行调整后，用户穿上外骨骼就可以直接行走。研究成果3月20日发表在《科学·机 。本文链接：科研人员开发出时空建模方法学工具包http://www.sushuapos.com/show-2-9345-0.html
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