11月14日,记者从中国科学院西北高原生物研究所获悉,该研究所张同作研究员联合青海大学魏青副教授等团队,成功组装了藏羚染色体级别的基因组,首次获得藏羚染色体水平的高质量基因组和注释信息,为藏羚的适应进化遗传机制、保护遗传学研究及进一步探索物种迁徙行为的遗传机制提供了重要基因组资源。相关结果发表在《自然》旗下综合性科学期刊《科学数据》上。
张同作向记者介绍,藏羚是世居青藏高原的典型反刍动物,平均分布海拔为3250米至5500米之间,是藏羚属唯一物种。19世纪中期至20世纪初,非法盗猎使藏羚的种群数量下降了约90%,2000年藏羚被IUCN红色濒危物种名录评估为濒危物种。经过30多年的保护,藏羚的种群数量恢复到了20多万只,世界自然保护联盟对其评级从濒危降为近危。
藏羚不仅是世界上分布海拔最高的反刍动物之一,也是青藏高原唯一具有长距离迁徙行为的物种,是研究高海拔适应性机制和迁徙行为的良好模型。然而迄今为止,公开数据库中仍缺少藏羚高质量的染色体水平基因组,严重限制了基于遗传特征解析其物种适应、进化及种群生态相关工作的开展。
基于PacBio HiFi三代基因组测序、Hi-C测序和DNBSEQ-T7二代基因组survey测序三种测序技术,研究团队成功组装了藏羚染色体级别的基因组。张同作表示,数据评估藏羚基因组BUSCO得分为98.2%,平均QV值为70.14,表明组装的连续性好,完整度和准确性高。基于EDTA和RepeatModeler从头预测的藏羚基因组中重复序列注释结果表明,藏羚基因组重复序列主要由SINEs、LINEs、LTRs 和DNA transposons四种类型组成,序列总长度为1.65Gb,占基因组的52.47%;基于蛋白同源预测、蛋白从头预测和深度学习等多种策略,在藏羚基因组上共注释到28330个功能基因。
11月14日,记者从中国科学院西北高原生物研究所获悉,该研究所张同作研究员联合青海大学魏青副教授等团队,成功组装了藏羚染色体级别的基因组,首次获得藏羚染色体水平的高质量基因组和注释信息,为藏羚的适应进化遗传机制、保护遗传学研究及进一步探索物种迁徙行为的遗传机制提供了重要基因组资源。相关结果发表在《自然》旗下综合性科学期刊《科学数据》上。
张同作向记者介绍,藏羚是世居青藏高原的典型反刍动物,平均分布海拔为3250米至5500米之间,是藏羚属唯一物种。19世纪中期至20世纪初,非法盗猎使藏羚的种群数量下降了约90%,2000年藏羚被IUCN红色濒危物种名录评估为濒危物种。经过30多年的保护,藏羚的种群数量恢复到了20多万只,世界自然保护联盟对其评级从濒危降为近危。
藏羚不仅是世界上分布海拔最高的反刍动物之一,也是青藏高原唯一具有长距离迁徙行为的物种,是研究高海拔适应性机制和迁徙行为的良好模型。然而迄今为止,公开数据库中仍缺少藏羚高质量的染色体水平基因组,严重限制了基于遗传特征解析其物种适应、进化及种群生态相关工作的开展。
基于PacBio HiFi三代基因组测序、Hi-C测序和DNBSEQ-T7二代基因组survey测序三种测序技术,研究团队成功组装了藏羚染色体级别的基因组。张同作表示,数据评估藏羚基因组BUSCO得分为98.2%,平均QV值为70.14,表明组装的连续性好,完整度和准确性高。基于EDTA和RepeatModeler从头预测的藏羚基因组中重复序列注释结果表明,藏羚基因组重复序列主要由SINEs、LINEs、LTRs 和DNA transposons四种类型组成,序列总长度为1.65Gb,占基因组的52.47%;基于蛋白同源预测、蛋白从头预测和深度学习等多种策略,在藏羚基因组上共注释到28330个功能基因。
记者3月18日从兰州大学获悉,该校动物医学与生物安全学院郑海学教授团队解析了非洲猪瘟病毒(ASFV)在猪体内感染的靶细胞,以及在靶细胞内延长感染的机制。这项研究系统阐明了ASFV感染的细胞嗜性、 据法新社巴黎3月15日报道,15日发布的一项新的重要分析称,影响神经系统的疾病——如中风、偏头痛和痴呆症——已经超过心脏病,成为全球范围内导致人们健康损害的主要原因。 美国和法国的科学家联合团队借助新的3D打印技术,开发出一种多层人造皮肤,只需18天即可长成。这种仿真皮肤可用于提升护肤品测试效率,并催生更好的皮肤治疗方法。相关研究发表于新一期《先进功能 3月23日消息,据媒体报道,iPhone与百度公司已达成合作协议,百度将为苹果内置的生成式人工智能大模型提供技术支持。报道指出,iPhone生成式人工智能大模型的合作伙伴包含谷歌、百度、OpenAI等公司。国 3月23日消息,xiaomi集团王晓雁晒出了xiaomiCivi 4 Pro限定色真机照,该系列共有三款颜色,分别是蓝色、粉色和黑与白,定价为3599元,将于4月1日开始发售。据了解,xiaomiCivi 4 Pro限定色整体设计更像专业 据英国《自然》周刊网站3月19日报道,研究人员首次利用生成式人工智能(AI)制造出全新抗体。报道称,本周生物学预印本资料库中的一份预印本报告的原理验证研究,提高了将“AI指导的蛋白质设计引入治 。本文链接:我国科学家公布世界首个藏羚染色体水平高质量基因组http://www.sushuapos.com/show-2-9368-0.html
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