科技日报北京2月10日电 (记者张梦然)美国麻省理工学院化学家们利用生成式人工智能(AI)技术,开发出一种可快速预测三维基因组结构的新模型。新模型能在几分钟内预测出数千种结构,速度远超现有的实验分析方法。研究成果发表于最新一期《科学进展》杂志。
ChromoGen模型利用序列数据从头预测染色质组织的流程图。图片来源:美国麻省理工学院
人体每个细胞都含有相同的遗传序列,但每个细胞只表达其中一部分基因。这种细胞特异性的基因表达模式确保了不同类型细胞之间的差异,而这些表达模式部分取决于遗传物质的三维结构。
新模型名为ChromoGen,旨在从底层DNA序列出发,预测三维基因组结构。它包括两个组成部分,第一部分是一个深度学习模型,能够“读取”基因组,分析编码在DNA序列和染色质可访问性数据中的信息;第二部分是一个生成式AI模型,经过训练后能够预测出物理上准确的染色质构象。
训练该模型所用的数据集包括超过1100万个染色质构象,这些数据来源于对16个人类B淋巴细胞系单细胞进行的实验。
ChromoGen模型能有效地捕捉序列—结构关系,为每段DNA序列生成多种可能的结构。这是因为DNA是一种非常无序的分子,同一个DNA序列可以产生许多不同的构象。这种方法不仅大大加速了三维基因组结构的预测过程,也为深入研究基因组的三维组织如何影响细胞的基因表达模式和功能提供了有力工具。
这一突破性技术有望帮助科学家更快地理解基因调控机制,促进疾病治疗和生物技术领域的进步。
中新网北京12月19日电 (记者 孙自法)施普林格·自然旗下专业学术期刊《自然-医学》最新发表一篇论文称,研究人 一年前,美国国家点火装置(NIF)产生了一种聚变反应,其释放的能量超过消耗的能量,这种现象被称为点火。今年,NIF通过一次又一次 2024年度中日韩前瞻计划项目指南 “中日韩前瞻计划”(A3 Foresight Program)是国家自然科学基金委员会(NSFC)与日本学 编者按 世界在变,变化中不断积蓄着突破的力量。局势纵横看似山重水复,历史规律昭示未来终将柳暗花明。2023年与我们挥 美国哈佛大学校长克洛迪娜·盖伊当地时间1月2日发表声明,宣布辞去哈佛大学校长一职。 盖伊在声明中说,她 1月18日,浙江科技大学、嘉兴大学分别在杭州、嘉兴举行揭牌仪式。面向未来,两所高校提出了各自的发展目标。 浙江科技大学 。本文链接:生成式AI快速预测三维基因组结构http://www.sushuapos.com/show-11-17228-0.html
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