记者3月20日从西湖大学获悉,该校未来产业研究中心杨剑课题组利用一种新方法,绘制出将疾病与相关细胞分布关联起来的“导航图”,并成功定位了抑郁症、精神分裂症等复杂疾病的相关细胞及其空间分布。相关研究成果当天在线发表于《自然》。
过去,全球科学家通过全基因组关联研究(GWAS),成功鉴定出大量与复杂疾病和人体特征相关的遗传变异。但该技术无法解释,这些变异如何通过人体中哪些特定的细胞,影响疾病的发生和发展。
“理论上,每个细胞都对应一组活跃表达的标签基因。这组基因就像是细胞的身份证,反映了细胞的类型、状态、空间位置等信息。”杨剑介绍,在研究过程中,课题组注意到近年来逐步成熟的新技术——空间转录组。GWAS将复杂疾病与特定基因关联起来,而空间转录组技术则将特定基因与细胞位置关联起来。
于是,研究团队试图开发出一种新方法,将两种技术方法结合起来,以基因为桥梁,将复杂疾病与细胞位置对应起来。
基于公共数据库中的大脑空间转录组数据,经过反复修改与调试,他们研发出一个创新性的数据分析模型,并将其命名为“gsMap”。该模型就像一张可以追踪疾病相关细胞的“导航图”。利用它,不仅能够识别复杂疾病所对应的细胞类型,还能“定位”到这些细胞在人体中的位置。
“借助gsMap,我们发现,不论是精神分裂症还是抑郁症,都与谷氨酸能神经元有显著关联。但在对应不同疾病时,它们的分布位置是不同的。”杨剑说。
具体而言,研究团队发现,与抑郁症关联的谷氨酸能神经元,集中分布在中脑和内侧前额叶皮层深部。分析显示,这些神经元表现出显著的可塑性特征:在受到特定刺激后,神经元突触会表现出较为灵活的变化,既可以互相连接,也可以互相断开。
不仅如此,活跃在这个位置的基因,与精神药物靶向的基因重合度较高,是其他大脑皮层区域的16倍,突显了该脑区在抑郁症干预和靶向治疗中的潜在作用。
此外,与精神分裂症关联的谷氨酸能神经元,集中分布于大脑皮层和海马区域,这些位置与智商相关的细胞位置非常接近,甚至存在重叠。
记者3月20日从西湖大学获悉,该校未来产业研究中心杨剑课题组利用一种新方法,绘制出将疾病与相关细胞分布关联起来的“导航图”,并成功定位了抑郁症、精神分裂症等复杂疾病的相关细胞及其空间分布。相关研究成果当天在线发表于《自然》。
过去,全球科学家通过全基因组关联研究(GWAS),成功鉴定出大量与复杂疾病和人体特征相关的遗传变异。但该技术无法解释,这些变异如何通过人体中哪些特定的细胞,影响疾病的发生和发展。
“理论上,每个细胞都对应一组活跃表达的标签基因。这组基因就像是细胞的身份证,反映了细胞的类型、状态、空间位置等信息。”杨剑介绍,在研究过程中,课题组注意到近年来逐步成熟的新技术——空间转录组。GWAS将复杂疾病与特定基因关联起来,而空间转录组技术则将特定基因与细胞位置关联起来。
于是,研究团队试图开发出一种新方法,将两种技术方法结合起来,以基因为桥梁,将复杂疾病与细胞位置对应起来。
基于公共数据库中的大脑空间转录组数据,经过反复修改与调试,他们研发出一个创新性的数据分析模型,并将其命名为“gsMap”。该模型就像一张可以追踪疾病相关细胞的“导航图”。利用它,不仅能够识别复杂疾病所对应的细胞类型,还能“定位”到这些细胞在人体中的位置。
“借助gsMap,我们发现,不论是精神分裂症还是抑郁症,都与谷氨酸能神经元有显著关联。但在对应不同疾病时,它们的分布位置是不同的。”杨剑说。
具体而言,研究团队发现,与抑郁症关联的谷氨酸能神经元,集中分布在中脑和内侧前额叶皮层深部。分析显示,这些神经元表现出显著的可塑性特征:在受到特定刺激后,神经元突触会表现出较为灵活的变化,既可以互相连接,也可以互相断开。
不仅如此,活跃在这个位置的基因,与精神药物靶向的基因重合度较高,是其他大脑皮层区域的16倍,突显了该脑区在抑郁症干预和靶向治疗中的潜在作用。
此外,与精神分裂症关联的谷氨酸能神经元,集中分布于大脑皮层和海马区域,这些位置与智商相关的细胞位置非常接近,甚至存在重叠。
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