胆肠吻合术的优点主要体现在解决胆道梗阻、改善消化功能和缓解不适症状等方面，让患者生活质量得到明显提高。
这种手术是将胆道与肠道直接相连，替代了受阻或受损的胆道部分。这在某些胆道疾病如胆道梗阻、胆总管狭窄或肿瘤引发的胆汁引流障碍中尤为重要，可有效缓解因胆汁淤积引起的黄疸、消化不良等问题。由于手术能够恢复胆汁流入肠道的正常通路，有助于改善脂肪消化和吸收，帮助患者恢复更好的营养状态。
与传统保守治疗相比，胆肠吻合术的最大优势在于可以从根本上处理胆汁流通问题，使病灶区域的压力得以释放，避免进一步的感染或其他严重并发症的发生。而与非手术治疗如引流管置入相比，此术式可避免反复的管路堵塞、感染风险及长期依赖外在引流装置的不便。
手术后患者应避免进食高脂肪食物，并按照医嘱复查肝功能及胆道通畅情况。同时，若术后出现黄疸再次加重、腹痛或发热等症状，应立即就医。
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