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研究解析人端粒杂合四链体高分辨三维结构

发布时间: 来源: 中国科学院

近日,中国科学院合肥物质科学研究院依托稳态强磁场实验装置超导磁体SM3及配套NMR系统,解析了由人类端粒DNA与TERRA RNA形成的异分子间杂合型G-四链体(G-Quadruplex,以下简称GQ)的原子级三维精细结构。gkd速刷资讯——每天刷点最新资讯,了解这个世界多一点SUSHUAPOS.COM

GQ在基因组转录、复制、端粒维持等生物学过程中发挥调控功能。RNA-DNA杂合型G-四链体(RDQ)在人类基因组中的潜在形成位点远超传统GQ,但其高分辨三维结构在PDB数据库中尚未被报道,制约了RDQ的功能研究与靶向药物开发。此外,RNA GQ长期以来被认为拓扑结构单一。因2'-OH的存在,rG残基几乎被锁定在anti构象,使天然RNA GQ几乎被预测折叠成平行拓扑结构。而DNA GQ展现出丰富的结构多态性,dG残基可自由地在synanti之间切换。DNA链与RNA链共同组装成RDQ时,究竟谁主导整体折叠构型、谁被动适配,仍是亟待解析的关键科学问题。gkd速刷资讯——每天刷点最新资讯,了解这个世界多一点SUSHUAPOS.COM

该研究利用液体NMR技术,解析了由人源端粒DNA链d(GGGTTAGGGTTAGGG)(htel3ΔT)与端粒单重复TERRA RNA链r(UAGGGU)(rP1)组装的RDQ全原子三维结构。实验显示,由于DNA链残基在该RDQ复合物中具有数量优势,其固有的结构多态性“迫使”整个体系采纳(3+1)杂合型拓扑。为满足这一拓扑的立体化学要求,RNA链中的rG23残基采取syn构象。这打破了“RNA G-四链体中rG只能以anti构象存在”的传统认知,证实RNA残基在天然RDQ组装中具备此前未曾被预料到的结构可塑性。gkd速刷资讯——每天刷点最新资讯,了解这个世界多一点SUSHUAPOS.COM

此外,RDQ在功能层面展现出双重生物学潜力。长链RNA及其降解的短链RNA片段可协同促进同源DNA双链解旋并参与R-loop的形成与稳定;RDQ的形成为其组成的DNA和RNA链提供核酸酶保护的庇护平台,并延长两者的酶促降解半衰期。gkd速刷资讯——每天刷点最新资讯,了解这个世界多一点SUSHUAPOS.COM

这项研究为理解RDQ在R-loop中的功能机制和端粒保护作用奠定了结构基础,并为靶向RDQ的药物设计提供了直观的结构模型。gkd速刷资讯——每天刷点最新资讯,了解这个世界多一点SUSHUAPOS.COM

相关研究成果发表在《美国化学会志》(JACS)上。研究工作得到国家自然科学基金、中国博士后基金、国家资助博士后研究人员计划(A档)等的支持。gkd速刷资讯——每天刷点最新资讯,了解这个世界多一点SUSHUAPOS.COM

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RDQ(htel3ΔT/rP1)结构形成示意图及其对端粒末端的保护作用gkd速刷资讯——每天刷点最新资讯,了解这个世界多一点SUSHUAPOS.COM

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