多倍化是植物演化的关键驱动力之一。同时，多倍化是植物进化和育种应用的重要机制，对物种遗传组成和习性具有重要影响。现今，广泛栽培的凤梨草莓为异源八倍体，其基因组具有高杂合性和高倍性的特点。随着测序技术与分型算法发展，高质量的单倍型基因组解析成为可能，但未有研究评估分型策略对多倍体基因组解析的影响。植物着丝粒是确保染色体在细胞分裂中精准分离的关键结构，其主要功能由组蛋白H3变体CENH3介导。蛋白H3标记动粒组装位点。因此，八倍体草莓的CENH3特异性抗体的制备与着丝粒准确鉴定至关重要，是探讨多倍体遗传习性的基础。
近日，中国科学院昆明植物研究所朱安丹专题组整合了不同类型数据，构建了八倍体草莓完全分型基因组，解析了八倍体草莓的着丝粒演化特征。
该研究以栽培草莓Albion×Akihime的杂交F1后代EA78为材料，评估不同分型策略发现，Trio-binning能够全局分型但连续性较低，Hi-C仅能够局部分型但连续性高。基于此，研究提出Two-step分型组装流程，并结合二者优势，构建了近乎完整的八倍体草莓EA78全局分型基因组。
基因组分析和FISH实验显示，八倍体草莓EA78六条染色体丢失了147 bp着丝粒保守的卫星序列簇。研究通过CENH3 ChIP-seq实验鉴定出6个新着丝粒与3类新着丝粒卫星，并发现它们保守着丝粒卫星簇与新着丝粒之间的序列相似性密度呈双峰分布，表明这些区域的序列保守性存在差异。同时，该研究发现染色体4C_mat发生着丝粒重定位现象。
该研究通过提升已发表的F. chiloensis和F. virginiana基因组连续性，比较了野生与栽培八倍体草莓的着丝粒卫星及其高阶重复结构特征。相较于二倍体祖先F. vesca，野生八倍体草莓的着丝粒长度和卫星簇丰度扩张，且在栽培草莓中进一步增强，表明多倍化和驯化可能推动着丝粒结构演化。
相关研究成果以A fully phased octoploid strawberry genome reveals the evolutionary dynamism of centromeric satellites为题，在线发表在《基因组生物学》（Genome Biology）上。研究工作得到国家自然科学基金、云南省相关项目的支持。
论文链接
近日，复旦大学马余刚院士团队和纽约州立大学石溪分校贾江涌教授团队合作在RHIC-STAR国际合作组首次基于高能重离子碰撞方 中国工程院院士、北京理工大学教授张军团队首创片上光谱复用感知架构，自主研制了全球首款百通道百万像素高光谱实时成像 近日，教育部公布第二批国家市域产教联合体名单，分别是江苏太仓、浙江宁波、浙江义乌、广西南宁、四川宜宾、新疆昌吉等6个市（县）。 教育部为何新布局建设这6家市域产教联合体？联合体如何走 应秘鲁总统博鲁阿尔特邀请，习近平主席将于11月13日至17日赴利马出席亚太经合组织第三十一次领导人非正式会议并对秘鲁进行国事访问。这是习近平主席时隔8年再次访问秘鲁，也是第二次赴利马出席 中国教育报-中国教育新闻网讯（记者 陈文静 通讯员 张少利 龙海燕 刘嫄 刘意 肖顺彬）日前，2024年世界职业院校技能大赛总决赛争夺赛财经商贸赛道三“关务实务小组”赛项在长沙航空职业技术学院（简 中国教育报-中国教育新闻网讯（记者 任朝霞 通讯员 袁圆）“我们创作的作品名称叫《古韵新景》，是由笔挂、笔山、镇纸、砚台组成的文房四宝。”10月27日，2024年世界职业院校技能大赛总决赛争夺赛高 。
本文链接：八倍体草莓单倍型定相与着丝粒演化动态研究获进展http://www.sushuapos.com/show-12-710-0.html
声明：本网站为非营利性网站，本网页内容由互联网博主自发贡献，不代表本站观点，本站不承担任何法律责任。天上不会到馅饼，请大家谨防诈骗！若有侵权等问题请及时与本网联系，我们将在第一时间删除处理。
上一篇： 研究揭示冷/热胁迫下膜流动性变化影响叶绿体蛋白稳态新机制
下一篇： 758项新版职业教育专业教学标准发布