记者27日从中国农业科学院获悉,该院农业基因组研究所农业基因编辑技术研发与应用创新团队构建了全球规模最大的实验验证数据集,并基于此开发出人工智能(AI)大模型AlphaCD。该模型不仅能高效预测超过2万余种胞嘧啶脱氨酶的酶活特征,还能设计出新型高性能碱基编辑工具。相关成果日前发表于国际期刊《细胞研究》。
胞嘧啶碱基编辑器是一种基因编辑工具,广泛应用于疾病治疗、动植物育种等研究领域。“但传统胞嘧啶碱基编辑器研发依赖大量试错实验,成本高、周期长,且难以系统优化酶活特征。”论文通讯作者、中国农业科学院农业基因组研究所研究员左二伟说。
为破解这一难题,研究团队历时3年,实验测试了1100种胞嘧啶脱氨酶变体的催化效率、脱靶效应等核心指标,首次建立了覆盖多维功能特征的大规模实验数据库。
基于该数据库,团队整合蛋白质序列、三维结构、理化性质等多模态数据,开发出AlphaCD。经严格验证,AlphaCD在预测胞嘧啶脱氨酶催化效率、脱靶活性、靶向窗口及基序偏好等关键指标时,准确性显著优于传统方法。
“AlphaCD突破了当前AI大模型依赖超算资源的局限。”左二伟介绍,研究团队采用随机森林算法发现,在个人计算机上即可完成模型训练。这一轻量化设计能让学术机构低成本开展高通量功能预测。
记者27日从中国农业科学院获悉,该院农业基因组研究所农业基因编辑技术研发与应用创新团队构建了全球规模最大的实验验证数据集,并基于此开发出人工智能(AI)大模型AlphaCD。该模型不仅能高效预测超过2万余种胞嘧啶脱氨酶的酶活特征,还能设计出新型高性能碱基编辑工具。相关成果日前发表于国际期刊《细胞研究》。
胞嘧啶碱基编辑器是一种基因编辑工具,广泛应用于疾病治疗、动植物育种等研究领域。“但传统胞嘧啶碱基编辑器研发依赖大量试错实验,成本高、周期长,且难以系统优化酶活特征。”论文通讯作者、中国农业科学院农业基因组研究所研究员左二伟说。
为破解这一难题,研究团队历时3年,实验测试了1100种胞嘧啶脱氨酶变体的催化效率、脱靶效应等核心指标,首次建立了覆盖多维功能特征的大规模实验数据库。
基于该数据库,团队整合蛋白质序列、三维结构、理化性质等多模态数据,开发出AlphaCD。经严格验证,AlphaCD在预测胞嘧啶脱氨酶催化效率、脱靶活性、靶向窗口及基序偏好等关键指标时,准确性显著优于传统方法。
“AlphaCD突破了当前AI大模型依赖超算资源的局限。”左二伟介绍,研究团队采用随机森林算法发现,在个人计算机上即可完成模型训练。这一轻量化设计能让学术机构低成本开展高通量功能预测。
南方财经全媒体记者 吴立洋 上海报道日前,2024中国家电及消费电子博览会(AWE)在上海新国际博览中心闭幕。作为一年一度的家电产业盛会,AWE既是各大厂商展示新技术与新产品的重要节点,也是 荷兰阿姆斯特丹大学医学院科学家开展的一项新研究证明,利用最新CRISPR-Cas基因编辑技术,能消除实验室中受感染细胞内所有艾滋病病毒(HIV)的痕迹,为治愈该病带来新希望。相关研究论文将提交于4月27 再打一局游戏就睡,再刷几个视频就睡,终于放下手机,关灯睡觉了……结果翻来覆去睡不着,半夜醒来再也睡不着,为什么明明睡着了,睡眠质量却不高?3月21日是世界睡眠日,最新发布的《2024中国 近日,美国纽约州立大学石溪分校科学家菲格罗阿等人在一篇发表于《自然·量子信息》上的论文中称,他们通过把两个独立的光子存储在铷气里,首次在室温条件下构建了一个量子存储器网络。鉴于 3月23日消息,京东与OPPO战略合作协议签约仪式举行,双方签订未来三年OPPO在京东全渠道实现销售额同比增长100%的目标。在签约仪式上,OPPO高级副CEO、首席产品官刘作虎表示,2024年线上突破是OPPO中国区 今天(23日)是第64个世界气象日,今年世界气象日的主题是“气候行动最前线”。地球是人类赖以生存和发展的家园,气候变化给人类造成的影响广泛而深远,关乎当下,更关乎未来。世界气象组织确认2023年全 。本文链接:设计基因编辑工具的AI大模型问世http://www.sushuapos.com/show-2-13599-0.html
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