德国马克斯·德尔布吕克中心尼古拉斯·拉杰斯基实验室团队开发出一种名为Open-ST的空间转录平台,能以三维(3D)方式重建患者组织细胞内的基因表达,并以亚细胞精度绘制出组织样本的分子图谱。相关论文发表在新一期《细胞》杂志上。
转录组学是研究细胞或细胞群中基因表达的学科,通常不包括空间信息,而空间转录组学则能测量组织样本中RNA在空间中的表达。Open-ST平台提供了一种经济高效、高分辨率、易于使用的方法,既可以拍摄样本的组织形态,也能拍摄组织切片的空间转录组学信息。该平台可以利用一系列2D图像,将其重建为3D“虚拟立体组织”。
在实验中,研究人员利用来自头颈癌患者健康和转移淋巴结的样本,成功识别出免疫、间质和肿瘤细胞群的多样性特征。这些细胞群是围绕原发肿瘤内的通讯热点组织起来的,但这种组织在转移瘤中被破坏了。
Open-ST平台根据癌症组织样本绘制的图像,突出显示了3D肿瘤或淋巴结边界处的潜在生物标记,这些标记可能成为新的药物靶点。而这些潜在生物标记在2D分析中是不可见的。
Open-ST平台为研究提供了前所未有的精度。例如,人们可以定位到3D图像中的任何位置,分析单个细胞内部的分子机制,或者健康细胞和癌细胞之间的边界。这有助了解癌细胞如何与周围环境互动,为探索癌细胞与免疫系统的相互作用提供了新视角。此外,该平台并不局限于癌症研究,还可用于探索多种类型的组织和生物体。
目前,研究人员已将整个实验和计算工作流程免费开放,以便广泛使用。
德国马克斯·德尔布吕克中心尼古拉斯·拉杰斯基实验室团队开发出一种名为Open-ST的空间转录平台,能以三维(3D)方式重建患者组织细胞内的基因表达,并以亚细胞精度绘制出组织样本的分子图谱。相关论文发表在新一期《细胞》杂志上。
转录组学是研究细胞或细胞群中基因表达的学科,通常不包括空间信息,而空间转录组学则能测量组织样本中RNA在空间中的表达。Open-ST平台提供了一种经济高效、高分辨率、易于使用的方法,既可以拍摄样本的组织形态,也能拍摄组织切片的空间转录组学信息。该平台可以利用一系列2D图像,将其重建为3D“虚拟立体组织”。
在实验中,研究人员利用来自头颈癌患者健康和转移淋巴结的样本,成功识别出免疫、间质和肿瘤细胞群的多样性特征。这些细胞群是围绕原发肿瘤内的通讯热点组织起来的,但这种组织在转移瘤中被破坏了。
Open-ST平台根据癌症组织样本绘制的图像,突出显示了3D肿瘤或淋巴结边界处的潜在生物标记,这些标记可能成为新的药物靶点。而这些潜在生物标记在2D分析中是不可见的。
Open-ST平台为研究提供了前所未有的精度。例如,人们可以定位到3D图像中的任何位置,分析单个细胞内部的分子机制,或者健康细胞和癌细胞之间的边界。这有助了解癌细胞如何与周围环境互动,为探索癌细胞与免疫系统的相互作用提供了新视角。此外,该平台并不局限于癌症研究,还可用于探索多种类型的组织和生物体。
目前,研究人员已将整个实验和计算工作流程免费开放,以便广泛使用。
3月20日对于我国抗衰老研究是个特殊的日子,经过近3年的不懈努力,八子补肾胶囊抗衰老取得又一重大突破。挑战人类生命极限是摆在全球科学家面前的重大课题,抗衰老研究已成为世界生命科学领域关注 3月21日是世界睡眠日,今年中国主题为“健康睡眠 人人共享”。人的一生约有三分之一的时间是在睡眠中度过,睡眠、运动、营养被视为保障机体正常发育和健康的三大要素。关于睡眠有哪些常见认知误 记者3月20日从西安交通大学第二附属医院获悉,该院皮肤病院夏育民教授科研团队研究设计了一种靶向抗双链抗体的D型模拟肽(D-ALW多肽)纳米微粒,成功应用于MRL/lpr红斑狼疮小鼠模型的治疗,为目前红斑 3月21日,由安徽省工业和信息化厅指导、中国光伏行业协会主办、阳光电源股份有限公司承办的“PAT2024爱光伏一生一世”先进技术研讨会在合肥举办。光储高压先进技术发布会现场。阳光电源股份有 21世纪经济报道记者 冯恋阁 王俊 广州、北京报道2013年播出的科幻电视剧《黑镜》第二季中有这样一个故事——女主角玛莎在男友艾什被车祸夺走生命之后,长久无法走出分离的痛苦,最终选 作为功能机时代的霸主,诺基亚手机曾经创造了巨大的辉煌,但也因错失智能手机发展机遇而“掉队”。近期,外媒Visual Capitalist统计了有史以来最畅销的15款手机型号,其中诺基亚和苹果包揽前十。今 。本文链接:新平台可绘制亚细胞精度的组织3D图http://www.sushuapos.com/show-2-7241-0.html
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