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迄今分辨率最高的野生稻-栽培稻泛基因组图谱绘就

发布时间: 来源: 中国科学院

亚洲栽培稻驯化历史可追溯至一万年前的普通野生稻。 面对全球人口增长和气候变化加剧的双重压力,如何将野生稻历经万年锤炼的“生存智慧”注入现代品种,培育出兼具高产潜力与抗病抗逆特性的“超级水稻”已成为重要研究课题。然而,传统依赖单一参考基因组的研究模式譬如以管窥天,仅能捕捉水稻遗传多样性的冰山一角。因此,亟需构建高质量、大规模的野生稻泛基因组,剖析其广泛的多样性,挖掘其耐逆、抗病等优良性状的遗传变异宝库。hox速刷资讯——每天刷点最新资讯,了解这个世界多一点SUSHUAPOS.COM

中国科学院院士、分子植物科学卓越创新中心研究员韩斌团队首次完成了145份亚洲栽培稻及普通野生稻的高精度基因组组装,绘制了迄今为止分辨率最高的野生稻-栽培稻泛基因组图谱,挖掘了普通野生稻广泛的遗传多样性,解析了亚洲栽培稻各类群的进化及驯化路线。该研究为水稻基因组辅助育种提供了关键的遗传资源,为培育抗病耐逆、适应气候变化的优质水稻品种奠定了科学基础。hox速刷资讯——每天刷点最新资讯,了解这个世界多一点SUSHUAPOS.COM

该团队整合具有代表性的129份普通野生稻和16份亚洲栽培稻资源,进行高质量基因组测序和从头组装,构建出可覆盖野生稻和栽培稻全面遗传景观的泛基因组图谱。这是该团队继解析水稻驯化路线和构建首个栽培稻-野生稻泛基因组草图后,在水稻基因组研究和进化领域取得的又一突破。hox速刷资讯——每天刷点最新资讯,了解这个世界多一点SUSHUAPOS.COM

这一参考基因组级别的栽培稻-野生稻泛基因组为原有公认的单个参考基因组新增了38.7亿个碱基对,包含69,531个基因,其中近20%为野生稻所特有。同时,这些基因被证实与抗病防御和环境适应性等性状相关。研究发现,野生稻中的抗病基因丰度和多样性均高于栽培稻,已精准定位到1,184个野生稻中拷贝数高于栽培稻的抗病基因位点,其中包括2个已验证的抗稻瘟病基因。这证实野生稻堪称作物改良的“战略资源库”,可为培育抗病耐逆的水稻品种提供直接的基因来源。hox速刷资讯——每天刷点最新资讯,了解这个世界多一点SUSHUAPOS.COM

该研究基于高质量的基因组序列,对亚洲栽培稻各类群中的早期关键驯化基因进行单倍型分析,证明所有亚洲栽培稻的驯化位点均来源于粳稻祖先Or-IIIa,证实亚洲栽培稻单起源假说,为持续数十年的学术争议提供证据。同时,研究还发现,南亚各栽培稻类群之间存在广泛的基因交流,并由此定义了新的栽培稻亚群intro-indica,绘制出一幅更全面的水稻进化和驯化路线图。hox速刷资讯——每天刷点最新资讯,了解这个世界多一点SUSHUAPOS.COM

上述研究构建了近饱和的野生稻泛基因组数据库,实现了野生稻遗传资源的系统性整合,弥合了野生稻和栽培稻基因组学研究的差距。科学家可据此精准挖掘野生稻优势等位基因,追溯重要基因的起源,解析水稻环境适应与表型可塑性机制。同时,这一研究为实现水稻快速从头驯化、精准培育抗逆性强、资源利用率高、产量突破的新品种提供了关键的基因资源。hox速刷资讯——每天刷点最新资讯,了解这个世界多一点SUSHUAPOS.COM

4月16日,相关研究成果以《野生和栽培稻精细泛基因组图谱》(A pangenome reference of wild and cultivated rice)为题,在线发表在《自然》(Nature)上。《自然》同期发布了题为Unlocking the diversity of wild and domesticated rice的研究简报研究工作得到国家自然科学基金、农业农村部重点研发项目、中国科学院战略性先导科技专项的支持。hox速刷资讯——每天刷点最新资讯,了解这个世界多一点SUSHUAPOS.COM

论文链接hox速刷资讯——每天刷点最新资讯,了解这个世界多一点SUSHUAPOS.COM

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野生稻和栽培稻泛基因组图谱hox速刷资讯——每天刷点最新资讯,了解这个世界多一点SUSHUAPOS.COM

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亚洲栽培稻进化路线图hox速刷资讯——每天刷点最新资讯,了解这个世界多一点SUSHUAPOS.COM

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