近日，中国科学院青岛生物能源与过程研究所与相关高校、企业等合作，开发出基于流式拉曼（RFC）的高通量、高精度益生菌快速质检技术。该成果为益生菌产品提供了单细胞分辨率的多参数质量评估手段，带来了“菌株身份证”级别的质量评估新方法。
益生菌产业是全球健康产业的重要分支。但是，益生菌产品质量参差不齐，核心技术标准尚不统一。益生菌产品的质量评价需涵盖菌种鉴定、活菌数量及菌株活力等参数，但传统检测方法存在周期长、准确率低、信息维度不足等问题，阻碍了产业发展。
该合作团队利用青岛能源所前期开发的基于拉曼组原理的单细胞精度益生菌质检（miRS）技术，开发出新一代基于RFC的高通量益生菌质检技术。
RFC技术融合了流式检测与单细胞拉曼光谱分析的优势，检测速度达1秒/细胞，较前期开发的miRS技术提升超10倍。这种高通量的检测能力在构建参考拉曼光谱数据库以及产品质量评估中展现出优势，能够获得更高的采样深度，从而提高菌种分类的准确性。研究表明，基于RFC的线性判别分析分类器对益生菌菌株的分类准确率达99.68%，即使在菌株丰度比1:1000的样品中，也能灵敏地检测出低丰度的菌株。
在活菌计数方面，RFC通过检测细胞对重水的代谢响应来快速测定活菌数量，与传统平板计数结果吻合，检测时间仅为传统方法的1/10。在代谢活力评估方面，RFC可定量评估产品整体的代谢活力，还可借助菌种分类算法计算产品中每一菌种/菌株的代谢活力/活性。此外，RFC技术具有自动化程度高、操作简便等特点，能够缩短检测周期和成本并提高检测效率。
相关研究成果发表在《宏组学》（iMetaOmics）上。研究工作得到国家重点研发计划和国家自然科学基金等的支持。
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基于流式拉曼的益生菌质检新技术
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